王建伟¹ , 贺晓岚^2* , 李文旭³ , 秦绍钊² , 汤宏¹ , 余星²

1 凯里学院理学院, 凯里, 556011; 2 凯里学院大健康学院, 凯里, 556011; 3 河南省农业科学院小麦研究所, 郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2022年01月11日    接受日期: 2022年01月21日    发表日期: 2023年03月13日

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HAM2 基因在植物生长、发育和应激反应中起重要的调控作用。本研究以油菜品种‘美国油王 88’和‘南油 868’为材料，通过 PCR 技术扩增 HAM2 完整编码区，利用生物信息软件进行序列分析，并通过PlantCARE 对其启动子序列进行分析。结果表明，Bn-HAM2-MY88 和 Bn-HAM2-NY868 的开放阅读框长度均为 1 326 bp，编码 441 个氨基酸，分子量分别约为 50.81 kD 和 50.86 kD，理论等电点分别为 7.88 和 7.56；亚细胞定位预测分析发现该基因编码的蛋白主要分布于细胞核；功能结构域 分析结果证实，Bn-HAM2-MY88 和 Bn-HAM2-NY868 蛋白都包含有保守的 MYST 结构域，属于 MYST 亚家族成员；多序列比对及进化树分析结果表明，Bn-HAM2-MY88 和 Bn-HAM2-NY868 与 NCBI 中公布的甘蓝型油菜组蛋白乙酰转移酶氨基酸序列(XP_013715766)相似性最高，分别为 99.77%和 100%，与拟南芥组蛋白乙酰转移酶序列(KAG7554717.1)相似性高达 90%以上；启动子分析表明，除含有真核生物启动子 TATA 和 CAAT 固有元件外，还存在 W-box、P-box、TGA-element、TC-rich repeats 等多种响应逆境胁迫的顺式元件。本研究结果为进一步研究 Bn-HAM2-MY88 和 Bn-HAM2-NY868 的生物学功能提供了基础资料。

油菜；Bn-HAM2 基因；克隆；生物信息分析